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Su antecedente fue una pequeña biblioteca que había en la calle de Santa Virgilia y dependía de la Junta de Distrito. En enero de 1987 se inaugura el centro actual dentro del parque Huerta de la Salud, situado en los terrenos de una antigua quinta cuyos orígenes se remontan al siglo XVIII.Esta quinta fue a principios del siglo XX un próspero negocio agropecuario con nuevos y originales elementos arquitectónicos, entre los que destacaba el silo, ahora emblema de Hortaleza. Caída la quinta en el abandono poco antes de la Guerra Civil, se derribaron en los años setenta algunas de sus construcciones, como el mirador o palomar y el granero, y solo quedaron en pie tres.

La biblioteca ocupó la estructura rehabilitada de uno de ellos, donde habían estado los establos del recinto, compartiendo espacio con el Centro Cultural Huerta de la Salud. En 1995, se traslada a otra construcción de la antigua quinta, donde se encuentra actualmente. El edificio -conocido como el corredor- había servido para guardar arados y herramientas y para dormir parte del personal.

En 2006 y 2007 se realiza una profunda reforma y adquiere su actual fisonomía. Por su historia, el edificio de la biblioteca conserva cierto aire arquitectónico rural. En octubre de 2018, su suerte se unió a la tercera construcción histórica del conjunto: el Silo, al que se había añadido un magnífico mirador a principios del siglo XXI y donde se realizan algunas actividades de la biblioteca.